1、分辨率高：分辨率是红外光谱仪的主要性能指标之一，指的是红外光谱仪对两个靠得很近的谱线的辨别能力;
2、波数精度高：波数是红外定性分析的关键参数，由于傅里叶变换光谱仪的动镜位置和光程差可通过激光的干涉条纹准确地测得，因此波数的可准确到0.01cm-1。
3、灵敏度高：由于干涉仪没有色散型仪器中的狭缝装置，因此相同分辨率的情况下红外光的输出通量大很多。它可以在较短的时间内实现多次扫描，从而使样品的信号得到累加、储存。
4、扫描速度快：普通色散性仪器是依次测定从狭缝出来的单色光的辐射而获得红外光谱，而傅里叶变换光谱仪的干涉仪能在整个扫描时间内同时测定所有频率的信息，因此能在很短的时间内获得分辨率高且低噪声的谱图。仪器可用于快速化学反应的追踪，解决气相色谱和红外的联用等问题。
5、光谱范围宽：通过改变光源、分束器和检测器可研究5~10000-1范围的光谱，而性能较好的色散型红外光谱仪的测量范围一般是200~4000cm-1(即中红外区)。
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